讲述北周一代贤臣独孤信幼女独孤伽罗，凭着自己的聪慧和毅力，一直顽强地生活在乱世之中，与杨坚的感情，从一开始的政治婚姻，渐渐演变到后来的两心相知，伉俪情深的两人最终共同联手，统一了全国，成为了大隋的开国帝后。

异国使臣叶千瑶带着“得独孤者得天下”的占卜预言前来朝贡，皇帝派遣左昭仪银氏接待，同意她们在到访期间可以随意游览长安，期间结识了大将军独孤信；与此同时，皇帝看到占卜的“独孤天下”预言，深感不安，于是召来仙长玄龙子，解读预言。随之而来的是一桩桩涉左昭仪等朝廷要员的离奇的案件，原来真正的使团早已在半路遇到击杀，而因冤案流落的叶千瑶乘机假扮身份，冒充异国使臣就是为了重回长安为自己父亲的死查明真相，独孤信身为长安密探组织锦麟士统领，接受皇帝密旨调查案件，与叶千瑶组队不断探究真相，随着案件的深入终于揭开了双头幻术的谜底，解除危机，挽救了朝廷与众生。

天生拥有异瞳的丽华，其父柳长丰惨死城门，九原村遭遇屠村。为查明真相，丽华与父亲下属萧葛寻着线索一路追查，好不容易在宇文护身上发现线索，却被凶手抢先灭口。所有受害者死状凄惨，似被异兽攻击。为获取更多线索，二人求助于会起尸术的阿漓前辈，发现这一切与利用藤族寄生秘术的叶千遥有关。为争夺独孤，叶千遥操控三头大蛇杀人，被丽华破除长生术后灰飞烟灭。本以为一切都已结束，却没想到，凶手另有其人啊……