200年前，超元世界的人类和来自其他世界的怪兽发生了战争。为了对抗强大的怪兽，人类发明了超元卡装置，将怪兽封印在超元卡中。云天是一位热爱超元卡比赛的少年，但是体质特殊的他无法控制好超元卡中的怪兽能量。一天，他意外获得了一个神奇的卡盒。云天决定前往寻找4张传说超元卡，希望用向超元卡许愿的方式找回哥哥。

少年云天所生活的世界是一个以超元卡竞技为主导的世界。超元卡在普通人手里只是简单的卡牌，但是这个世界上存在着一种特殊能力者，他们被称作绝战者。绝战者之间流行着一种名为超元绝战的竞技比赛，绝战者之间的一切纠纷和矛盾都可以用超元绝战来解决。因此，强大的绝战者在这个世界中享有崇高的地位。