曾经教导少年银时等人的师父吉田松阳，化作不同的人格，意图带着地球一起结束自己的生命。为了阻止他的野心，昔日盟友银时、高杉、桂决定带着心中的信念并肩作战。此外，万事屋的新八和神乐、新选组、歌舞伎町，甚至曾经的宿敌齐聚一堂，为银时等人应援，为保护自己该保护的东西而拼死一搏……

《银魂 最终篇》是为《银魂》整个故事画上句号的作品。